鄭俊杰

生物資訊分析家

關於我

專注於生物資訊分析及生物統計

電子信箱

My Github

工作經歷

  • 研究助理 (國立交通大學)Apr 2019 - Now

學歷

  • 海洋生物科技暨資源學系 (國立中山大學)Sep 2012 - Jun 2016
  • 生物資訊與結構生物研究所 (國立清華大學)Sep 2016 - Jul 2018

技能

  • 1. R語言(資料處理套件 tidyverse, 網頁設計套件 shiny, 串接資料庫套件 RMySQL)
  • 2. 網頁設計語言 HTML & CSS
  • 3. Linux shell command
  • 4. 版本控制軟體 Git & Github
  • 5. 輕量虛擬化技術--容器 Docker & Dockerhub
  • 6. 高效能運算叢集系統 HPC, PBS (Portable Batch System)

經驗

  • 1. 使用 R 語言來開發微生物菌叢分析工具 MOCHI,讓使用者可以以簡單的圖形介面來處理 16S rRNA NGS 序列,並提供統計分析。
  • 2. 利用 R 語言套件 shiny 以及 HTML & CSS 來設計 MOCHI 操作介面。
  • 3. 利用 R 語言套件 tidyverse 來進行資料前處理以及視覺化分析。
  • 4. 使用 Git & Github 管理 MOCHI 的程式碼。
  • 5. 利用容器技術 Docker 來架設 MOCHI 網站。編寫 Dockerfile 以製作 MOCHI image、利用 docker-compose 指令以簡化容器之操作。